很快目暮警部带着3个助手警官，其他大批的警察和鉴识人员到了。奇怪的是目暮警部居然认识这个死去的老和尚，而根据尸检初步推断死亡时间是昨夜10点到12点之间，第一发现人是宽念和尚。宽念解释自己在师父房间没有人，就沿着寺庙到处寻找，最后在修行室发现了。
目暮警官头疼，“于是听到宽念的叫声就冲过来的，正好在这里借宿的”小五郎立马接上，“目暮警官，正是我，名侦探毛利小五郎”目暮警官脸上抽了抽筋皮笑肉不笑的说：“呵呵，魂淡，跟你说了多少次，不要随便在外面过夜，你知不知道自己走到哪里都会死人真是的，连寺庙的佛祖都镇压不住你这个死神”
毛利小五郎转移话题问宽念，“为什么你会知道天永主持会吊在横梁上”“这”宽念无话可说，“他当然会注意到”木念走过来，“因为两年前这里发生过同样的事情。”大叔有些疑惑，目暮警官点头，“没错，那次也是我负责侦办的，死者好像是年轻的忠念和尚，发现死者的是宽念和木念，对不对”二人点头肯定，木念仔细说起当年的事情。
那件事发生在梅雨季节，在这里闭关修行的忠念，在墙上打了个大洞，突然消失不见了。其他人找了3天都没有踪迹，所有人都以为忠念离开寺庙还俗去了，一定是不想在做假和尚了。然而在第4天早上，宽念和木念来修行室修理墙壁，不经意抬头向上看，才发现忠念吊死在天花板上。
墙上的破洞跟这次的完全相似，起初和尚们以为是忠念逃走时弄破的，可是房间的门并没有上锁。这件案子，目暮警官最终以自杀结案的。后来，负责修理墙壁的木匠说这么大的洞，一个人的话要弄上一整天才行，除非是传说中的远古妖怪才能办到，譬如说雾天狗。
经过一番调查，目暮警官得出结论是唯一的可能就是死者自己先攀绳上去，再用这根绳子在梁上做一个套，套在自己脖子上往下一跳，就一了百了了。证据就是地上还有用来切断剩余绳索的斧头。唯一解释不通的地方，就是那个破掉的墙壁，不知道是怎么弄得。而目暮警官认为，无论是在墙上打洞，还是在高高的天花板上吊死等方式都是模仿那个古老的传说。目暮警官很是头疼的说道“好像在故意暗示别人，自己丧命于能在天空中任意飞舞的雾天狗手中，真是无聊啊”
琴摇摇头说：“不是自杀”“为什么”“死者是自杀的话，他也需要用绳子从底下直接攀爬上去，你认为年过七旬的天永和尚有这样的力气吗再说，墙壁破了如此大的洞，却没看到墙壁上的木板碎片，你们不觉得很奇怪吗”大家都觉得奇怪，都在思索着。这时，一对男女哭着跑进来，是天永的孙女菊乃，旁边是她的丈夫，是寺庙的继承人。
琴随口问，“秀念师父，你昨晚念书很晚吗”秀念说自己一直念到凌晨3点多。千钧觉得他嫌疑，“你有没有注意发生什么譬如说有人偷跑出去，敲东西之类的恐怖声音，或者有人发出尖叫”
秀念有些疑惑，“没有啊，什么都没有听到，昨晚一直安静得很。”柯南也一愣，“真的什么也没有”秀念点头，“我离师父的房间较远，可是几个师兄的房间都在隔壁，所以有什么声音的话应该会知道。”秀念反应过来，“你们在怀疑我们吗”柯南急忙说没有，千钧也说随便问问。这时屯念喊秀念帮忙，秀念答应一声便匆匆离去。
柯南考虑到目前线索不够，到瀑布下游寻找证物。柯南在岸边寻找，琴脱了衣服在水中找寻。所要找的东西就是被凶手丢弃的墙壁木板的碎片，只要这些东西才能知道凶手为何一定要将其丢弃，以及作案的手法。
柯南在草丛中了木板的碎片，上面还有胶带。琴从水中冒出，大声说道：“秀念师傅，你在干什么”远处在水中的人被吓了一跳，转过头僵硬的说：“我在找东西，你呢”“唉，我是来洗澡的，可我忘了来的路，不如你带我回去吧”“哦，好”
回到寺庙，目暮警官正想撤队，琴连忙跑上去报告，“目暮警官，我知道凶手是谁了”“唔，是谁”“凶手先把瀑布的水由天窗处引入房间，将整个房间都注满水，凶手就能和迷晕的老和尚由横梁的正下方漂浮起来，再把老和尚绑在横梁上，就完成了”“可是，尸体并没有湿啊”“用橡皮艇啊，宽念师父说过寺里有橡皮艇的。”目暮警官傻眼了，没想到寺庙连这种工具都有。“瀑布跟天窗之间还有些距离，无论如何，他也不能顺利地把水引进来的啊”目暮警官大声辩解，“，用木板就能办到。先用胶带把木板的缝隙粘起来，再把木板翻过来，就可以将瀑布的水引到天窗这边。”
这些可以从木板被割过就可以知道，是为了让长度能刚好配合的缘故，而且贴过胶带的地方都粘着一排樱花花瓣，这些樱花花瓣是从瀑布上游冲下来的。鉴识人员也告诉目暮警官，柯南这个小鬼提醒过他们，就拍下了木板上樱花照片。毛利小五郎指出，“樱花不止在木板上有，应该还有些干的花瓣飘到警官的脚下，这些花瓣都是凶手让水流掉时黏在墙上的。”目暮警官弯腰从地上捡起花瓣，的确如此。
“总的来说，凶手的手法是杀死老和尚后，把他搬到这个房间，放入橡皮艇，再把大门门缝用胶带封死，再次底部的小窗户处爬到外面，到2楼天窗处将瀑布的流水放入。再跑回1楼，从小窗户处爬进去，用胶带将小窗户的缝隙也封起来。之后要注意不要让尸体被流水打湿，等流水将整个屋子注满水涨船高，达到横梁处时将死者用绳子吊起来，再从天窗爬出去，用遗留在现场的小斧头从外面把小窗户打破，根据帕斯卡定理，底部会承受不住水的巨大压力，被立即冲破。而且喷出来的水势非常汹涌，墙壁转瞬间就破掉，裂开了下面那个大洞”
这时，琴忽然问：“秀念师父，你昨晚念书到凌晨3点钟，没错吧那昨晚的惨叫声，你应该听到了才对，昨夜2点钟时有人被吓得大声尖叫，请你告诉我们那个人是谁其他三位师父都知道这件事了。”宽念也转过身来看着秀念，秀念急忙道，“我也听到了的。是毛利兰小姐”
毛利侦探叹息，“当时尖叫不是小兰，也不是其他几位小姐，是我才对。也难怪你没听到，因为你整个晚上都在水声隆隆的修行室。”目暮警官大喜，“毛利老弟，证据呢”毛利好笑，“目暮警官，刚才宫本警官不是已经将证物都给你了吗”目暮警官明白过来，就是那些碎片，那是秀念唯一没有来得及收拾好的东西。“琴从水里捞出来的木板碎片只能当做佐证来证明凶手的手法，但柯南拿回来的胶带上面肯定还有凶手的指纹因为那东西冲到山下后没有流入水中，而是飞溅到了河边的草丛中。秀念后来想到了这个破绽，就偷偷去找过这些东西，但被琴发现，为了不引起怀疑只好被迫回到寺里。”
最后，秀念承认了自己的罪行，他是为了替自己的亲生哥哥忠念报仇，之后，便和目暮警官回去了。
柯南之后宫天下